Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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