Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ttc21bQ0HA38 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms