Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb2Q00977 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms