Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
DmdP11531 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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DmdP11531 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
DmdP11531 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DmdP11531 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DmdP11531 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
DmdP11531 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DmdP11531 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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