Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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