Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprtQ99M80 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PtprtQ99M80 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PtprtQ99M80 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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