Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms