Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms