Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Hotair-201ENSMUST00000151949 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38252-201ENSMUST00000192701 2616 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dgka-201ENSMUST00000026414 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12109-201ENSMUST00000121140 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Hk1os-202ENSMUST00000142968 343 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13645-201ENSMUST00000145163 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg12-206ENSMUST00000153474 606 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Mir2139-201ENSMUST00000158669 95 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22871-201ENSMUST00000177097 54 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28419-201ENSMUST00000189108 475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11232-201ENSMUST00000084489 1680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr120-202ENSMUST00000207771 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Napb-201ENSMUST00000028926 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Nup98-204ENSMUST00000211005 3961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Commd2-202ENSMUST00000160959 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26672-202ENSMUST00000180931 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Rsrc1-203ENSMUST00000065074 3224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp42-203ENSMUST00000211248 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14094-201ENSMUST00000117717 610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12431-201ENSMUST00000120693 168 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20548-205ENSMUST00000174864 787 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29441-201ENSMUST00000191584 211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC134900.1-201ENSMUST00000216575 266 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms