Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms