Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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