Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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