Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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