Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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