Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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