Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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PtprmP28828 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
PtprmP28828 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PtprmP28828 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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PtprmP28828 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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PtprmP28828 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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PtprmP28828 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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PtprmP28828 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PtprmP28828 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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