Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms