Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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