Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Usp29Q9ES63 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms