Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dnajc28Q8VCE1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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