Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp27Q8CEG8 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms