Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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