Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Cntn3Q07409 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Cntn3Q07409 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Cntn3Q07409 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Cntn3Q07409 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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Cntn3Q07409 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Cntn3Q07409 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Cntn3Q07409 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Cntn3Q07409 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Cntn3Q07409 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cntn3Q07409 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms