Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Smim18J3QNP2 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms