Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 AC165260.6-201ENSMUST00000225447 1735 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm37315-201ENSMUST00000194347 3479 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SrfQ9JM73 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr1221-204ENSMUST00000217635 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms