Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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