Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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