Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cntn3Q07409 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms