Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms