Protein–RNA interactions for Protein: V9GXK0

Gm12117, Predicted gene 12117, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12117V9GXK0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12117V9GXK0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms