Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms