Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm26938S4R185 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm26938S4R185 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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