Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd1Q9Z2E2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms