Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn8Q9Z260 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn8Q9Z260 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms