Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms