Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf1Q9Z1B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms