Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp5Q9Z131 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5Q9Z131 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms