Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms