Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dctn3Q9Z0Y1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dctn3Q9Z0Y1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dctn3Q9Z0Y1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dctn3Q9Z0Y1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms