Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xpr1Q9Z0U0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xpr1Q9Z0U0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms