Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn13Q9Z0S4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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