Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin2Q9WVE8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin2Q9WVE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms