Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skp1Q9WTX5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skp1Q9WTX5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms