Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma1Q9R1P4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms