Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nubp2Q9R061 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms