Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh2d3cQ9QZS8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms