Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403.2 ms