Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd1Q9QY80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms