Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx4Q9QY61 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms