Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms